Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT4C9JH25 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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