Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF28PB7ZC32 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF28PB7ZC32 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF28PB7ZC32 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms