Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSDA5PKW4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms