Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms