Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPDC1A2A3K4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms