Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms