Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms