Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A0A087WUJ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A0A087WUJ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms