Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 3-0.02□□□□□ -2.411e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-204ENST00000445842 560 ntTSL 522.72■■□□□ 1.236e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.567e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.387e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.356e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 316.89■□□□□ 0.296e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 216.74■□□□□ 0.276e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RIOK1-203ENST00000475351 960 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.257e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-206ENST00000482175 2040 ntTSL 216.59■□□□□ 0.257e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-207ENST00000513585 1572 ntTSL 216.42■□□□□ 0.227e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD39-202ENST00000443120 4965 ntTSL 216.29■□□□□ 0.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.126e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPRD1B-203ENST00000462548 2436 ntTSL 515.28■□□□□ 0.047e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-204ENST00000462692 857 ntTSL 515.19■□□□□ 0.027e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HDAC6-218ENST00000470942 668 ntTSL 314.9□□□□□ -0.027e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.057e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.116e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 P4HB-213ENST00000484286 759 ntTSL 214.35□□□□□ -0.117e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-205ENST00000463868 646 ntTSL 313.67□□□□□ -0.226e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-207ENST00000493869 658 ntTSL 213.67□□□□□ -0.226e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPRD1B-206ENST00000495457 542 ntTSL 413.41□□□□□ -0.267e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-205ENST00000476975 1132 ntTSL 513.02□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HDAC6-229ENST00000486665 598 ntTSL 212.67□□□□□ -0.387e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 GRIPAP1-203ENST00000474512 904 ntTSL 211.59□□□□□ -0.557e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-206ENST00000477869 582 ntTSL 511.44□□□□□ -0.586e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TMEM263-202ENST00000547081 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.627e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 KDM5C-212ENST00000481369 1361 ntTSL 210.16□□□□□ -0.787e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 29.9□□□□□ -0.826e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 KDM5C-209ENST00000465402 720 ntTSL 39.13□□□□□ -0.957e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 PDXDC1-215ENST00000567306 980 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUF2-211ENST00000531529 255 ntTSL 37.25□□□□□ -1.257e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-206ENST00000512751 570 ntTSL 36.82□□□□□ -1.327e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-204ENST00000455688 664 ntTSL 26.31□□□□□ -1.46e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MORF4L1-213ENST00000559244 582 ntTSL 36.3□□□□□ -1.47e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 UBR5-205ENST00000519365 602 ntTSL 35.8□□□□□ -1.486e-13■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MORF4L1-207ENST00000558539 595 ntTSL 55.19□□□□□ -1.587e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 UBR5-208ENST00000520898 582 ntTSL 34.66□□□□□ -1.666e-13■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-202ENST00000502635 514 ntTSL 54.37□□□□□ -1.717e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BDP1-205ENST00000514903 5511 ntTSL 54.16□□□□□ -1.747e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUF2-210ENST00000527439 940 ntTSL 33.9□□□□□ -1.797e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RIOK1-201ENST00000264874 1988 ntTSL 53.06□□□□□ -1.927e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BDP1-206ENST00000525844 4997 ntTSL 1 (best)2.27□□□□□ -2.057e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUF2-209ENST00000527120 351 ntTSL 31.1□□□□□ -2.237e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-204ENST00000535423 537 ntTSL 424.48■■□□□ 1.511e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-214ENST00000543803 577 ntTSL 324.48■■□□□ 1.511e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-210ENST00000542019 737 ntTSL 323.76■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-219ENST00000545600 579 ntTSL 423.76■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-207ENST00000539399 553 ntTSL 423.65■■□□□ 1.381e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-212ENST00000543088 601 ntTSL 423.65■■□□□ 1.381e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-205ENST00000535819 788 ntTSL 323■■□□□ 1.271e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.851e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-208ENST00000539741 573 ntTSL 420.17■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-210ENST00000531921 1697 ntTSL 217.58■□□□□ 0.411e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-211ENST00000532054 532 ntTSL 217.14■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-212ENST00000532444 633 ntTSL 515.38■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-201ENST00000323213 889 ntTSL 514.75□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HEMK1-204ENST00000443894 634 ntTSL 314.29□□□□□ -0.121e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-211ENST00000542667 613 ntTSL 313.7□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ZNF276-212ENST00000569901 548 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CDK9-204ENST00000491521 510 ntTSL 313.42□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DHPS-218ENST00000600510 1085 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.291e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-209ENST00000531186 565 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SMARCD2-207ENST00000578234 595 ntTSL 211.83□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HEMK1-207ENST00000482974 3265 ntTSL 210.47□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-202ENST00000524711 1645 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-217ENST00000641999 482 nt8.63□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-213ENST00000641728 668 nt8.48□□□□□ -1.051e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-205ENST00000635394 474 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC7.6□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-202ENST00000571639 348 ntTSL 37.36□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-203ENST00000575792 473 ntTSL 37.36□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 UBR4-212ENST00000475973 600 ntTSL 37.1□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-215ENST00000641906 641 nt7.06□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-209ENST00000641294 521 nt7.02□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-206ENST00000641033 660 nt6.88□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-216ENST00000641990 570 nt6.33□□□□□ -1.41e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-207ENST00000641096 379 nt6.08□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-212ENST00000641621 575 nt5.83□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ITPR2-207ENST00000540791 575 ntTSL 34.33□□□□□ -1.721e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-207ENST00000530026 769 ntTSL 24.18□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CDC14B-210ENST00000480920 459 ntTSL 32.66□□□□□ -1.981e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.149e-27■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.961e-26■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 223.61■■□□□ 1.371e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 316.85■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-209ENST00000456404 914 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 8.1
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