Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 3-0.02□□□□□ -2.411e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-204ENST00000445842 560 ntTSL 522.72■■□□□ 1.236e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.567e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.387e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.356e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 316.89■□□□□ 0.296e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 216.74■□□□□ 0.276e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RIOK1-203ENST00000475351 960 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.257e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-206ENST00000482175 2040 ntTSL 216.59■□□□□ 0.257e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-207ENST00000513585 1572 ntTSL 216.42■□□□□ 0.227e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD39-202ENST00000443120 4965 ntTSL 216.29■□□□□ 0.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.126e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPRD1B-203ENST00000462548 2436 ntTSL 515.28■□□□□ 0.047e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-204ENST00000462692 857 ntTSL 515.19■□□□□ 0.027e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HDAC6-218ENST00000470942 668 ntTSL 314.9□□□□□ -0.027e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.057e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.116e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 P4HB-213ENST00000484286 759 ntTSL 214.35□□□□□ -0.117e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-205ENST00000463868 646 ntTSL 313.67□□□□□ -0.226e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-207ENST00000493869 658 ntTSL 213.67□□□□□ -0.226e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPRD1B-206ENST00000495457 542 ntTSL 413.41□□□□□ -0.267e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ANKRD23-205ENST00000476975 1132 ntTSL 513.02□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HDAC6-229ENST00000486665 598 ntTSL 212.67□□□□□ -0.387e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 GRIPAP1-203ENST00000474512 904 ntTSL 211.59□□□□□ -0.557e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-206ENST00000477869 582 ntTSL 511.44□□□□□ -0.586e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TMEM263-202ENST00000547081 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.627e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 KDM5C-212ENST00000481369 1361 ntTSL 210.16□□□□□ -0.787e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 29.9□□□□□ -0.826e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 KDM5C-209ENST00000465402 720 ntTSL 39.13□□□□□ -0.957e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 PDXDC1-215ENST00000567306 980 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUF2-211ENST00000531529 255 ntTSL 37.25□□□□□ -1.257e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-206ENST00000512751 570 ntTSL 36.82□□□□□ -1.327e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ALAS2-204ENST00000455688 664 ntTSL 26.31□□□□□ -1.46e-22■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MORF4L1-213ENST00000559244 582 ntTSL 36.3□□□□□ -1.47e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 UBR5-205ENST00000519365 602 ntTSL 35.8□□□□□ -1.486e-13■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MORF4L1-207ENST00000558539 595 ntTSL 55.19□□□□□ -1.587e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 UBR5-208ENST00000520898 582 ntTSL 34.66□□□□□ -1.666e-13■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DCP2-202ENST00000502635 514 ntTSL 54.37□□□□□ -1.717e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BDP1-205ENST00000514903 5511 ntTSL 54.16□□□□□ -1.747e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUF2-210ENST00000527439 940 ntTSL 33.9□□□□□ -1.797e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RIOK1-201ENST00000264874 1988 ntTSL 53.06□□□□□ -1.927e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BDP1-206ENST00000525844 4997 ntTSL 1 (best)2.27□□□□□ -2.057e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUF2-209ENST00000527120 351 ntTSL 31.1□□□□□ -2.237e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-204ENST00000535423 537 ntTSL 424.48■■□□□ 1.511e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-214ENST00000543803 577 ntTSL 324.48■■□□□ 1.511e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-210ENST00000542019 737 ntTSL 323.76■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-219ENST00000545600 579 ntTSL 423.76■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-207ENST00000539399 553 ntTSL 423.65■■□□□ 1.381e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-212ENST00000543088 601 ntTSL 423.65■■□□□ 1.381e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-205ENST00000535819 788 ntTSL 323■■□□□ 1.271e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.851e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-208ENST00000539741 573 ntTSL 420.17■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-210ENST00000531921 1697 ntTSL 217.58■□□□□ 0.411e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-211ENST00000532054 532 ntTSL 217.14■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-212ENST00000532444 633 ntTSL 515.38■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-201ENST00000323213 889 ntTSL 514.75□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HEMK1-204ENST00000443894 634 ntTSL 314.29□□□□□ -0.121e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TM7SF3-211ENST00000542667 613 ntTSL 313.7□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ZNF276-212ENST00000569901 548 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CDK9-204ENST00000491521 510 ntTSL 313.42□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DHPS-218ENST00000600510 1085 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.291e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-209ENST00000531186 565 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SMARCD2-207ENST00000578234 595 ntTSL 211.83□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HEMK1-207ENST00000482974 3265 ntTSL 210.47□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-202ENST00000524711 1645 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-217ENST00000641999 482 nt8.63□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-213ENST00000641728 668 nt8.48□□□□□ -1.051e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-205ENST00000635394 474 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC7.6□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-202ENST00000571639 348 ntTSL 37.36□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-203ENST00000575792 473 ntTSL 37.36□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 UBR4-212ENST00000475973 600 ntTSL 37.1□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-215ENST00000641906 641 nt7.06□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-209ENST00000641294 521 nt7.02□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-206ENST00000641033 660 nt6.88□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-216ENST00000641990 570 nt6.33□□□□□ -1.41e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-207ENST00000641096 379 nt6.08□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-212ENST00000641621 575 nt5.83□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ITPR2-207ENST00000540791 575 ntTSL 34.33□□□□□ -1.721e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EIF3M-207ENST00000530026 769 ntTSL 24.18□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CDC14B-210ENST00000480920 459 ntTSL 32.66□□□□□ -1.981e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.149e-27■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.961e-26■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 223.61■■□□□ 1.371e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 316.85■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-209ENST00000456404 914 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 8.1
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