Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAD1L1Q9Y6D9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms