Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PLXND1Q9Y4D7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms