Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2J1Q9Y385 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2J1Q9Y385 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms