Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L8

ZKSCAN5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN5Q9Y2L8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZKSCAN5Q9Y2L8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZKSCAN5Q9Y2L8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN5Q9Y2L8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN5Q9Y2L8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZKSCAN5Q9Y2L8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms