Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH4Q9UQ05 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNH4Q9UQ05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH4Q9UQ05 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH4Q9UQ05 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms