Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP18Q9UMW8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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