Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC7AQ9ULT0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC7AQ9ULT0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms