Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCPG1Q9ULG6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCPG1Q9ULG6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms