Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SARDHQ9UL12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARDHQ9UL12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms