Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms