Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA1Q9UIW2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms