Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAX2Q9UIW0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms