Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPN4Q9UHM6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms