Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPC1L1Q9UHC9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NPC1L1Q9UHC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms