Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM10Q9UDY6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms