Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms