Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL42Q9P2K6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms