Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP35Q9P2H5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP35Q9P2H5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
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