Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSRB1Q9NZV6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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