Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms