Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCKIPSDQ9NZQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCKIPSDQ9NZQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms