Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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