Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ08

ERAP1, Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERAP1Q9NZ08 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERAP1Q9NZ08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERAP1Q9NZ08 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms