Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP4R2Q9NY27 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms