Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP5S1Q9NUS5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms