Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL1Q9NSC2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL1Q9NSC2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms