Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOMER2Q9NSB8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOMER2Q9NSB8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms