Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPRMQ9NS64 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPRMQ9NS64 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms