Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms