Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCL28Q9NRJ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms