Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCB9Q9NP78 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms