Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBF2Q9HAK2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF2Q9HAK2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms