Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EHD4Q9H223 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EHD4Q9H223 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms