Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPRTNQ9H040 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPRTNQ9H040 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms