Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GFRA4Q9GZZ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms