Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLIRPQ9GZT3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLIRPQ9GZT3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms