Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms