Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPF3BQ9BZI7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UPF3BQ9BZI7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms