Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF4Q9BZC1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms