Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms