Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms